Die rechtlichen Organe des PROLIST® INTERNATIONAL e.V. sind Mitgliederversammlung und Vorstand. Die Geschäftsführung und Geschäftsstelle sind vom Vorstand beauftragt. Die Standardisierungsarbeit wird von den Arbeitsgruppen ausgeführt. Der Technische Beirat koordiniert die Arbeitsgruppen und konsolidiert die Arbeitsergebnisse.